Det amerikanska inbördeskrigets slag är välkända, men det var kriget till sjöss som utformade resultatet. Havsarkeologer och historiker ger sig ut på jakt efter inbördeskrigets hemligheter djupt nere på havsbotten. Vetenskapliga data kombineras med datorgrafik i syfte att dränera haven och undersöka krigets förlorade vrak.